南川河的主要污染：南川河是湟水河的主要支流，不仅对湟水河的水源补给和流域内的农田灌溉起着非常重要的作用，而且还对西宁地下水的补给和流域内生态环境的调整起着至关重要的作用。但是，这条承载了多少代人美好记忆的河流，如今却面临着被泥沙污染和大量垃圾侵蚀的危害。浑浊的河水不但使南川河正在逐渐失去利用的价值，而且已经开始严重影响生态环境。
1、砂石场是河水变黄的祸首。
2、脏臭伴着南川河入城。
整治：
西宁市南川河整治工程(昆仑桥至入湟水河口段)于2003年12月31日通过青海省水利专家们的验收，改造后的南川河已成为西宁市促进生态建设，美化城市景观的一道亮丽风景线。
南川河位于西宁市中心，全长49公里，过去的南川河，河道内垃圾成堆，污水横流，2002年4月30日，我市争取投资对1.8公里长的南川河昆仑桥至入湟水河口段进行整治，新建防洪堤3.7公里，钢筋砼封闭式输水渠3.7公里，橡胶坝6座，园林式绿地1.12万平方米，建成后的河道行洪宽度54—80米，工程累计完成投资3000多万元，于当年9月30日竣工。
1、西宁市湟水河道治理工程（2015年底）：治理湟水河黑嘴桥至青藏铁路桥段左岸K18+470-K24+375，右岸K18+437-K23+580。堤防级别为2级，地震设防烈度为Ⅶ度，设计防洪标准为50年一遇。新建堤防采用合金钢丝石笼护坡形式，防汛道路路面结构采用C20透水砼路面。
2、西宁市湟水河城区段水利功能提升改造工程（2016年初）：防洪标准采用100年一遇。工程首先将实施的是分水工程，即在海湖桥(第二自来水厂)附近实施分水工程，将原本的一条河道分为一主一副两个河道，主河道为景观河道，副河道为泄洪河道。非汛期，尽量将浑水分向泄洪河道，有利于主河道内的浑水沉淀，为市民呈现出良好的景观效果;汛期，根据上游来水量进行调度，主河道与泄洪河道联合泄洪，安全度汛。
工程特点：建设一主一副两个河道、引来清澈中水补给到主河道内、修建导流工程。同时，采取截污纳管、关闭沿河采砂场等措施，有望让湟水河摆脱“**”皮肤。在主河道上，利用坝体打造出多个小瀑布，为湟水河上增添新景观。还将实施南川河导流工程。通过采取分水工程、暗涵等多项工程建设，湟水河主河道的水可以得到极大改善，为了保持水质，通过导流工程，让南川河的水直接流入副河道，即泄洪河道，保持河水清澈底色。
